Python Module Index

p


	p
	`ppanggolin`
	`ppanggolin.align`
	`ppanggolin.align.alignOnPang`
	`ppanggolin.annotate`
	`ppanggolin.annotate.annotate`
	`ppanggolin.annotate.synta`
	`ppanggolin.cluster`
	`ppanggolin.cluster.cluster`
	`ppanggolin.context`
	`ppanggolin.context.searchGeneContext`
	`ppanggolin.edge`
	`ppanggolin.figures`
	`ppanggolin.figures.draw_spot`
	`ppanggolin.figures.drawing`
	`ppanggolin.figures.tile_plot`
	`ppanggolin.figures.ucurve`
	`ppanggolin.formats`
	`ppanggolin.formats.readBinaries`
	`ppanggolin.formats.write_proksee`
	`ppanggolin.formats.writeAnnotations`
	`ppanggolin.formats.writeBinaries`
	`ppanggolin.formats.writeFlatGenomes`
	`ppanggolin.formats.writeFlatPangenome`
	`ppanggolin.formats.writeMetadata`
	`ppanggolin.formats.writeMSA`
	`ppanggolin.formats.writeSequences`
	`ppanggolin.geneFamily`
	`ppanggolin.genetic_codes`
	`ppanggolin.genome`
	`ppanggolin.graph`
	`ppanggolin.graph.makeGraph`
	`ppanggolin.info`
	`ppanggolin.info.info`
	`ppanggolin.main`
	`ppanggolin.meta`
	`ppanggolin.meta.meta`
	`ppanggolin.metadata`
	`ppanggolin.metrics`
	`ppanggolin.metrics.fluidity`
	`ppanggolin.metrics.metrics`
	`ppanggolin.mod`
	`ppanggolin.mod.module`
	`ppanggolin.nem`
	`ppanggolin.nem.partition`
	`ppanggolin.nem.rarefaction`
	`ppanggolin.pangenome`
	`ppanggolin.projection`
	`ppanggolin.projection.projection`
	`ppanggolin.region`
	`ppanggolin.RGP`
	`ppanggolin.RGP.genomicIsland`
	`ppanggolin.RGP.rgp_cluster`
	`ppanggolin.RGP.spot`
	`ppanggolin.utility`
	`ppanggolin.utility.utils`
	`ppanggolin.utils`
	`ppanggolin.workflow`
	`ppanggolin.workflow.all`
	`ppanggolin.workflow.panModule`
	`ppanggolin.workflow.panRGP`
	`ppanggolin.workflow.workflow`